В 9784-ом году ницшеанцы подняли восстание против Содружества Систем. Они стремились обрести независимость, избавиться от постоянного контроля, получить возможность устанавливать собственные законы и порядки. Восстание привело к масштабной войне, которая может изменить весь мир. Чтобы остановить врага, Содружество Систем направило в сторону флота ницшеанцев крейсер Звездной Гвардии под названием "Созвездие Андромеды". Крейсером командует опытный воин – капитан Дилан Хант, который участвовал во многих непростых битвах в космическом пространстве. Никто не мог предположить, что самое большое и мощное военное судно, которое когда-либо было создано людьми, попадется в западню ницшеанского флота. Так как возможности спастись не было, капитан дал экипажу команду экстренно эвакуироваться с корабля. При этом сама "Андромеда" и вместе с Диланом на борту попала в плен временной аномалии на границе черной дыры в системе Гефеста. Война закончилась плохо для обеих сторон. Содружество Систем пало, однако и ницшеанцы не смогли построить свою Империю. Вселенная на долгие годы погрузилась в тьму и хаос. Дилан Хант и "Андромеда" вернулись из временной петли спустя 303 года, хотя для капитана прошло лишь мгновение. Вскоре Дилан находит союзников, которые вместе с ним готовы начать выполнять миссию по восстановлению Содружества Систем.