«Lego Супергерои DC: Лига справедливости – Космическая битва» посвящена Лиге справедливости, которая пытается разрушить коварные планы инопланетного киборга по уменьшению Земли. Во Вселенной на одной из планет Зактивикслю спокойно жили миролюбивые существа, которые никогда не вели войн. Так бы и продолжалось, но на планету неожиданно было совершено нападение летающих дронов. Они исследовали местность и исчезли. Затем яркий красный луч пронзил и уменьшил планету до размера небольшого шарика. Инициатором захвата был киборг Брейниак. Одним из его странных хобби было коллекционирование планет в баночках и расстановка их на полках по алфавиту. С Зактивикслю случилась досадная оплошность: планету при уменьшении деформировали. Теперь злодей киборг ищет другую планету на букву «З» для пополнения своей коллекции. Выбор пал на Землю. Однако на ее защите стоит Лига справедливости, и Брейниаку будет непросто осуществить свой замысел. Первая попытка закончилась неудачей киборга. Однако он не готов отступить, и тщательно планирует следующую вылазку. Идея была такова – отправить героев в разные временные промежутки, чтобы расправиться со всеми по-отдельности. Злодею удается отправить Супермена, Чудо-женщину и Зеленого фонаря в прошлое, однако бесстрашные Бэтмен и Флеш сооружают машину времени и отправляются в путешествие за своими друзьями.
